כולל 'זכרון יוסף' די, אשר הוקם במודיעין עילית על ידי הרב ראובן נח כהן, מחבר הספר 'אמרי ראובן' לפני כ-15 שנה, ונושא את שמו של הרב יוסף זצ"ל.

כולל 'זכרון יוסף' אינו 'עוד כולל'. בין כתליו לומדים אברכים מצוינים, וכל מטרתו- להופכם לתלמידי חכמים אמיתיים, הזוכים לסיים את הש"ס פעמים רבות בחייהם. הכולל מהווה מאגר תורני אדיר, חי ונושם.

'זכרון יוסף' הינו בית וועד לתלמידי חכמים, דוגמת ישיבות העבר, בם נרקם התלמוד, וכל אחד מתלמידי החכמים הינו בעל שליטה עצומה בש"ס כולו, והתמחות נדירה בכמה סדרים ממנו, לכל עומקם. לשם כך, בונה הכולל תוכניות לימוד ייחודיות, ואף מחלק את קבוצות הלומדים באורח שונה מן המקובל, על מנת להעשיר את תלמידיו בידע תורני עצום, אך ללא התפשרות על ההתמצאות המעמיקה בכל נבכי ים התלמוד.

הכולל תומך כלכלית ב-כחמישים תלמידים, האברכים אשר התקבלו אליו, ומחולקים לשבעה 'כוללים'- 'חבורות'. שישה מן הכוללים- נושאים כל אחד את שמה של מסכת משישה סדרי משנה; "כולל זרעים", "כולל מועד", "כולל נשים", "כולל נזיקין", "כולל קדשים" ו"כולל טהרות", כשבנוסף להם- ישנו "כולל קבלה"- לאריות שבחבורה. בכל כולל לומדים עד עשרים וחמישה אברכים בשיטת הלימוד הייחודית לכולל 'זכרון יוסף', אשר לפיה, מסיימים התלמידים יחד את הש"ס, בתום כל מחזור לימוד בן שבע שנים.

הנהלת הכולל שמה לנגד עיניה את דברי הרב פיינשטיין זצ"ל, כי אברכים בני עליה מתייאשים מלגמור את הש"ס, באופן שיחקוק את החומר הנלמד ויהפוך לנכס ברזל, ויצרו מציאות בלתי נתפסת של תפיסת כמות עצומה באיכות נדירה, ומדי שבע שנים זוכה להגשמת החזון, כשאברכי הכולל, הידוע בשל שיטתו המופלאה, עורכים סיום על הש"ס, בהגיעם לעומקי הרבדים של החומר הנלמד.